হত দরিদ্র জনগোষ্ঠির আর্থ-সামাজিক উন্নয়ন ও মানব সেবা উন্নয়ন কার্যক্রম পরিচালনার লক্ষ্যকে সামনে রেখে এনজিওগুলো কাজ করে যাচ্ছে। কিন্তু তার মধ্যে একটি অংশ সরকারি অনুমোদন নিয়ে কিংবা অনুমোদনের রীতি ভেঙ্গে ঋণের নামে টাকার অঙ্ক ফাঁকা রাখা ব্যাংক চেক গ্রহন করে, গ্রাহকদের ঠকানোর পাশাপাশি সর্বশান্ত করার মত অসাধু কর্ম করে যাচ্ছে বলে অভিযোগ পাওয়া গেছে।
এনজিওগুলো সরকারি অনুমোদন পেয়ে গ্রামের অসহায় মানুষকে ব্যবসা, কৃষিকাজ, মৎস্য চাষসহ বিভিন্ন কাজের জন্য ঋণ প্রদান করে থাকে। এলাকার নিরিহ মানুষ এসব কাজের জন্য সমিতি/এনজিও থেকে ঋণ গ্রহন করে থাকে বিভিন্ন শর্তসাপেক্ষে। যার মধ্যে দলিল, স্বাক্ষরকৃত নন-জুটিশিয়াল সাদা স্ট্যাম্প, ব্যাংকের সাদা চেক (স্বাক্ষরকৃত) জামানত হিসাবে জমা রাখতে হয়। চেক বা স্ট্যাম্পে ঋণের প্রকৃত টাকার অঙ্ক বসিয়ে জামানত হিসাবে রাখলে অভিযোগ ছিলনা। কিন্তু ঋণের কিস্তি পরিশোধের কোন একপর্যায়ে অপারগতার কারণে ঋণ পরিশোধে সমর্থ না হলে কিংবা বিলম্বিত হতে থাকলে কোন কোন ঋণদ্বাতা সংস্থা তাদের কাছে রক্ষিত স্ট্যাম্প ও চেকে ইচ্ছেমত টাকার অঙ্ক বসিয়ে মিথ্যা মামলা রুজু করে থাকে বলে অভিযোগ রয়েছে। ফলে নিরিহ ঋণ গ্রহিতারা টাকার পাহাড়সম ঋণের বোঝা মাথায় নিয়ে আত্মগোপনে যেতে বাধ্য হয়ে থাকে। তাদরে সংসার ক্রমে ক্রমে রসাতলে পড়ে যায়। অপরদিকে কিছু কিছু এনজিও এলাকায় অফিস খুলে বড় অংকের টাকা হাতিয়ে নিয়ে উধাও হওয়ার ঘটনাও ঘটছে। আর এ- পি’র বিভিন্ন শাখা, দারুস সালাম লিঃ (সোনালী উন্নয়ন ফাউন্ডেশন), হায় হায়, সোপট, জয়েন্ট ইসলামি ফাইনান্স, ফুলতোলা সমবায় সমিতি প্রভৃতি এনজিও প্রতারণার কারবার গ্রাহকদের ঠকিয়েছে বলে অভিযোগ রয়েছে। তাদের কাছে ঋণ গ্রহিতাদের রাখা স্ট্যাম্প বা ব্যাংক চেক ব্যবহার করে এনজিও নয় বর্তমানে প্রভাবশালীদের সহায়তায় ব্যক্তি বাদি হয়ে মিথ্যা মামলা দায়েরের অভিযোগও পাওয়া গেছে। আশাশুনির চিলেডাঙ্গা গ্রামের শাহাবুদ্দিন সরদারের পুত্র জোবায়ের, ধান্যহাটির গহর আলির পুত্র নজরুল, আমিনুর, গোদাড়ার শামছুদ্দিন মোড়ল, কুড়িকাহুনিয়ার হযরত আলি, গোদাড়ার বোরহান উদ্দিন, লতিফ মোড়ল, সোনাটির ছালাম গাজী, কালিগঞ্জের সহিদুল ইসলামসহ অনেকে মামলার শিকার হয়েছেন। জোবায়ের হোসেন বলেন, তিনিসহ মিথ্যা মামলার শিকার অনেকেই চরম বিপাকে রয়েছেন। বিষয়টি তদন্তপূর্বক ব্যবস্থাগ্রহনের জন্য সংশ্লিষ্টদের প্রতি দাবি জানিয়েছেন তারা।